Balkan halkları Ortaçağ’da Hıristiyanlığın Ortodoksluk mezehebine girmişlerdir.
Özellikle Bulgarlar ve Sırplar kendi krallıklarını kurduktan sonra İstanbul’daki Patrikhaden
bağımsız patrikhanelerini kurmuşlardır. Fakat Osmanlılar Balkanları fethettikten sonra
Balkanlardaki bağımsız kiliselerin varlığına son vererek bu kiliseleri İstanbul’daki
Patrikhaneye bağlamışlardır. Fatih Sultan Mehmed İstanbul’un fethinden sonra Patrikhaneyi
yeniden düzenleyerek bir Osmanlı kurumu haline getirmiştir. Osmanlı dönemi boyunca
Patrikhane Ortodokslardan sorumlu en önemli kurum olmuştur. 16. Yüzyılın ikinci yarısında
Sokollu Mehmed Paşa İpek’teki Sırp Patrikhanesini yeniden kurmuş ve başına bir akrabasını
getirmiştir. Bu patrikhane de 18. Yüzyılın ikinci yarısında Ohri Başpiskoposluğu ile birlikte
tekrar kapatılmıştır. 19. Yüzyıla kadar Ortodoksluğun merkezi İstanbul olmuştur. Halkların
kilise tabiiyetine göre tasnif edilmesine millet sistemi adı verilmiştir.
