Ana Sayfa » Ankara Üniversitesi ANKADEM » Kimya Bölümü Biyokimya Anabilim Dalı » (B) Biyokimya 1

Ünite 8: Peptit Bağı ve Özellikleri — Kavram Eşleştirme

Tur 1 / 20 / 5 eşleşti

Önce bir kavram seç, sonra karşılığı olan tanıma dokun.

Kavramlar

Tanımlar

Yukarıdan bir kavram seç.

Peptit Bağı — Bir amino asidin alfa-amino grubu ile ikinci bir amino asidin alfa-karboksil grubunun reaksiyona girerek su açığa çıkarmasıyla oluşan kovalent bağdır. Rezonans etkisi nedeniyle yüzde kırk civarında kısmi çift bağ karakteri taşır ve etrafındaki dönüşleri kısıtlar.

Amit Düzlemi — Peptit bağını oluşturan karbon ve azot atomları ile bunlara doğrudan bağlı olan dört atomun üzerinde yer aldığı düzlemsel yapı alanıdır. Peptit bağının rijit yapısı nedeniyle bu düzlem etrafında serbest dönme hareketi gerçekleşemez.

Oligopeptit — 20 veya daha az sayıda amino asidin peptit bağlarıyla birbirine bağlanması sonucu meydana gelen nispeten kısa zincirli peptit molekülleridir. Daha uzun amino asit zincirlerinden oluşan yapılara ise polipeptit adı verilir.

Konformasyon — Normal fizyolojik koşullar altında bir protein molekülünün uzayda doğal olarak aldığı, biyolojik aktiviteye sahip en dayanıklı ve en kararlı üç boyutlu düzenlenme biçimidir. Proteinlerin fonksiyonları bu özel konformasyonun varlığına bağlıdır.

X-Işını Kristalografisi — Pauling ve Corey tarafından 1930 yılında amino asit ve proteinlerin yapısını detaylı incelemek amacıyla geliştirilen deneysel yöntemdir. Bu yöntem sayesinde atomlar arası uzaklıklar, bağ açıları ve peptit gruplarının düzlemsel yapısı belirlenmiştir.

Alfa-Heliks Yapısı — Polipeptit zincirinin hayali bir ana eksen etrafında düzenli biçimde kıvrılarak ilerlediği, karbonil oksijeni ile azot hidrojenleri arasında eksene paralel hidrojen bağlarının kurulduğu sekonder protein yapısıdır.

Beta-Tabakalı Yapı — amit düzlemlerinin periyodik olarak birbiri ardı sıra tabakalar halinde uzandığı, valin ve izolösin gibi amino asitlerin oluşturma eğiliminde olduğu ikincil protein yapı biçimidir.

Disülfür Bağı — İki sistein amino asidi arasında kurulan ve proteinlerin tersiyer yapısını kararlı kılmada büyük rol oynayan güçlü kovalent bağ türüdür. Bu bağ protein molekülünün üç boyutlu yapısının korunmasına katkı sağlar.

Esansiyel Amino Asitler — İnsan organizması tarafından sentezlenemeyen ve vücut fonksiyonlarının sürdürülebilmesi için dışarıdan besinlerle mutlaka alınması gereken sekiz temel amino asittir; valin, lösin ve lizin bunlara örnektir.

Denatürasyon — Proteinlerin peptit bağları parçalanmaksızın, aşırı sıcaklık veya pH değişimleri nedeniyle üç boyutlu doğal yapılarını ve buna bağlı biyolojik aktivitelerini kaybetmesi durumudur.