Peptit BağıBir amino asidin alfa-amino grubu ile ikinci bir amino asidin alfa-karboksil grubunun reaksiyona girerek su açığa çıkarmasıyla oluşan kovalent bağdır. Rezonans etkisi nedeniyle yüzde kırk civarında kısmi çift bağ karakteri taşır ve etrafındaki dönüşleri kısıtlar.
Amit DüzlemiPeptit bağını oluşturan karbon ve azot atomları ile bunlara doğrudan bağlı olan dört atomun üzerinde yer aldığı düzlemsel yapı alanıdır. Peptit bağının rijit yapısı nedeniyle bu düzlem etrafında serbest dönme hareketi gerçekleşemez.
Oligopeptit20 veya daha az sayıda amino asidin peptit bağlarıyla birbirine bağlanması sonucu meydana gelen nispeten kısa zincirli peptit molekülleridir. Daha uzun amino asit zincirlerinden oluşan yapılara ise polipeptit adı verilir.
KonformasyonNormal fizyolojik koşullar altında bir protein molekülünün uzayda doğal olarak aldığı, biyolojik aktiviteye sahip en dayanıklı ve en kararlı üç boyutlu düzenlenme biçimidir. Proteinlerin fonksiyonları bu özel konformasyonun varlığına bağlıdır.
X-Işını KristalografisiPauling ve Corey tarafından 1930 yılında amino asit ve proteinlerin yapısını detaylı incelemek amacıyla geliştirilen deneysel yöntemdir. Bu yöntem sayesinde atomlar arası uzaklıklar, bağ açıları ve peptit gruplarının düzlemsel yapısı belirlenmiştir.
Alfa-Heliks YapısıPolipeptit zincirinin hayali bir ana eksen etrafında düzenli biçimde kıvrılarak ilerlediği, karbonil oksijeni ile azot hidrojenleri arasında eksene paralel hidrojen bağlarının kurulduğu sekonder protein yapısıdır.
Beta-Tabakalı Yapıamit düzlemlerinin periyodik olarak birbiri ardı sıra tabakalar halinde uzandığı, valin ve izolösin gibi amino asitlerin oluşturma eğiliminde olduğu ikincil protein yapı biçimidir.
Disülfür Bağıİki sistein amino asidi arasında kurulan ve proteinlerin tersiyer yapısını kararlı kılmada büyük rol oynayan güçlü kovalent bağ türüdür. Bu bağ protein molekülünün üç boyutlu yapısının korunmasına katkı sağlar.
Esansiyel Amino Asitlerİnsan organizması tarafından sentezlenemeyen ve vücut fonksiyonlarının sürdürülebilmesi için dışarıdan besinlerle mutlaka alınması gereken sekiz temel amino asittir; valin, lösin ve lizin bunlara örnektir.
DenatürasyonProteinlerin peptit bağları parçalanmaksızın, aşırı sıcaklık veya pH değişimleri nedeniyle üç boyutlu doğal yapılarını ve buna bağlı biyolojik aktivitelerini kaybetmesi durumudur.
