
Altın Orda sahasından günümüze gelebilen en önemli eserlerden biri, Cengiz Han'ın torunlarının hizmetinde bulunmuş eğitimli bir kişi olan Ötemiş Hacı tarafından 1550 yılında Çağatay Türkçesiyle yazılmış olan Tarih-i Dost Sultan adlı kitaptır; eser Cengiz Han'dan XIV. yüzyılın sonuna kadar olan olayları içerir.
Özbeklerin baskısıyla Türkistan'dan ayrılarak Hindistan'da Babürlüler Devleti'ni kuran Zahirüddin Muhammed Babür'ün Türkçe olarak kaleme aldığı otobiyografi türündeki Bâbürnâme, 1494-1529 yılları arasını kapsayan ve dünya klasikleri arasında yer alan eşsiz bir Çağatay edebiyatı şaheseridir.
Buhara'da 1500 ile 1920 yılları arasında hüküm süren Şeybanî, Astrahanî ve Mangıt Özbek hanedanları döneminde, bölgedeki yoğun Tacik ve Fars kültürü etkisiyle yazılan 70'e yakın tarih el yazması neredeyse tamamen Farsça kaleme alınmış, hanlığın resmi dili de Farsça olmuştur.
Hive Hanlığı'nda tarih yazıcılığını başlatan Ebulgazi Bahadır Han (1603-1663), Harezm'deki Şeybanî hanları soyundandır ve XV. yüzyılın ikinci yarısından 1665'e kadar olan olayları duru bir Çağatay Türkçesiyle kaleme aldığı Şecere-i Türk ve Şecere-i Terâkime adlı eserleriyle aktarmıştır.
Alman asıllı Rus tarihçisi V. V. Barthold (1869-1930), Çarlık sonu ve Sovyetlerin ilk döneminde yayımladığı eserlerle (özellikle Moğol İstilasına Kadar Türkistan) Orta Asya bilimsel tarihçiliğinin temellerini atmış, kaynakları tahlil eden eleştirel ekolün kurucusu olmuştur.
Sovyetler Birliği tarafından 1924 yılında Orta Asya sınırlarının 'milli' esaslara göre yapay bir şekilde şekillendirilmesinden sonra, bu yeni siyasi sınırların tarihî haklılığını ispat etmek ve meşrulaştırmak amacıyla her cumhuriyette yerel elitlerin teşvikiyle resmi ideolojiye uygun milli tarih yazıcılığı geliştirilmiştir.
XIX. yüzyılın sonlarında Kırımlı İsmail Gaspıralı'nın önderliğinde eğitimde 'usûl-i cedid' (yeni usul) olarak başlayan Ceditçilik hareketi, zamanla İdil-Ural, Kafkasya ve Türkistan'da toplumsal, kültürel ve siyasi modernleşmenin, kadın haklarının ve ulusal bilincin uyanmasının öncüsü olmuştur.
Rusya kökenli büyük Türk tarihçisi Zeki Velidi Togan, 'Bugünkü Türkili (Türkistan) ve Yakın Tarihi' (1942-47) ile 'Hâtıralar' (1969) adlı eserlerinde dinî reformculuk, Ceditçilik ve Türkistan'daki Basmacılık hareketi hakkında birinci elden en kıymetli bilgileri ve tahlilleri sunmuştur.